Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcc4E9Q236 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcc4E9Q236 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms