Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krt90E9Q1Z0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt90E9Q1Z0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt90E9Q1Z0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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