Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp3E9Q1T6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrp3E9Q1T6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms