Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3250E9Q1M3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms