Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Zfp558E9Q1J0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp558E9Q1J0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Zfp558E9Q1J0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Zfp558E9Q1J0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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