Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gimd1E9PW74 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gimd1E9PW74 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gimd1E9PW74 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms