Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG4

Crisp4, Cysteine-rich secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp4E9PVG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp4E9PVG4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp4E9PVG4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms