Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc175E9PVB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc175E9PVB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms