Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Galntl6E5D8G1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Galntl6E5D8G1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Galntl6E5D8G1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Galntl6E5D8G1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Galntl6E5D8G1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms