Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fam46aD3Z5S8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Fam46aD3Z5S8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Fam46aD3Z5S8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Fam46aD3Z5S8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Fam46aD3Z5S8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam46aD3Z5S8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms