Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms