Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
3425401B19RikD3Z1D3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
3425401B19RikD3Z1D3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms