Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn24D3YXJ9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cldn24D3YXJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn24D3YXJ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms