Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930444P10RikD3YUR1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms