Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cttnbp2B9EJA2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cttnbp2B9EJA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cttnbp2B9EJA2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cttnbp2B9EJA2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms