Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pnldc1B2RXZ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms