Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Siah3B2RWG3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah3B2RWG3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah3B2RWG3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms