Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh2B2RVB7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms