Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AU015836B2RUM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AU015836B2RUM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms