Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc22a28B2RT89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc22a28B2RT89 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc22a28B2RT89 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms