Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ythdc2B2RR83 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ythdc2B2RR83 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ythdc2B2RR83 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms