Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H60cB1B213 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H60cB1B213 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms