Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms