Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930402K13RikB1AW18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930402K13RikB1AW18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms