Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Supt3B0QZW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Supt3B0QZW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Supt3B0QZW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms