Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tmem238A9JSM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms