Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6880A3KG45 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6880A3KG45 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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