Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Htra4A2RT60 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms