Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms