Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Samt1A2BED8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt1A2BED8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms