Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabreA2AMW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GabreA2AMW3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms