Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Frmpd1A2AKB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Frmpd1A2AKB4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Frmpd1A2AKB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms