Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Lcn6A2AJB9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Lcn6A2AJB9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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Lcn6A2AJB9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Lcn6A2AJB9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn6A2AJB9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lcn6A2AJB9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lcn6A2AJB9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lcn6A2AJB9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lcn6A2AJB9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn6A2AJB9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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