Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc183A2AJB1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc183A2AJB1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms