Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prdm12A2AJ77 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm12A2AJ77 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm12A2AJ77 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms