Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VirmaA2AIV2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VirmaA2AIV2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VirmaA2AIV2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms