Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap5A2AGT5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ckap5A2AGT5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap5A2AGT5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap5A2AGT5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap5A2AGT5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ckap5A2AGT5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ckap5A2AGT5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms