Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef6A2A8M8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pramef6A2A8M8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms