Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itgb4A2A863 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb4A2A863 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms