Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Rnf19bA2A7Q9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf19bA2A7Q9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf19bA2A7Q9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Rnf19bA2A7Q9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.33■■□□□ 1
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