Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm6268A2A3U9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm6268A2A3U9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm6268A2A3U9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms