Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrp1bA1Z198 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nlrp1bA1Z198 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms