Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trav12-2A0N8N6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trav12-2A0N8N6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trav12-2A0N8N6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trav12-2A0N8N6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trav12-2A0N8N6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trav12-2A0N8N6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trav12-2A0N8N6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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