Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc173A0JLY1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc173A0JLY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms