Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930469K13RikA0A286YDB2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms