Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms