Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Trbv2A0A0B4J1G8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv2A0A0B4J1G8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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