Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv31A0A075B5J5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv31A0A075B5J5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv31A0A075B5J5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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