Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrit3W8DXL4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrit3W8DXL4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms