Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac6Q9Z2V5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac6Q9Z2V5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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